Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms