Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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PtprcapQ64697 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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PtprcapQ64697 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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PtprcapQ64697 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprcapQ64697 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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