Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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