Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Taf6Q62311 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Taf6Q62311 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Taf6Q62311 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Taf6Q62311 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Taf6Q62311 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Taf6Q62311 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Taf6Q62311 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Taf6Q62311 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Taf6Q62311 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms