Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm5dQ62240 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5dQ62240 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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