Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp1Q62209 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms