Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a1Q60714 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms