Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3aQ60520 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms