Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc5a6Q5U4D8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms