Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms