Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk4Q3V129 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms