Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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BC051142Q3V0M8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC051142Q3V0M8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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