Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms