Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Prdm6Q3UZD5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Prdm6Q3UZD5 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Prdm6Q3UZD5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Prdm6Q3UZD5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Prdm6Q3UZD5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Prdm6Q3UZD5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Prdm6Q3UZD5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Prdm6Q3UZD5 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Prdm6Q3UZD5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms