Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms