Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kdm5aQ3UXZ9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms