Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BtrcQ3ULA2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BtrcQ3ULA2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms