Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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