Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hvcn1Q3U2S8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms