Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LcorlQ3U285 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms