Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms