Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms