Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Ccndbp1Q3TVC7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Ccndbp1Q3TVC7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Ccndbp1Q3TVC7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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