Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms