Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms