Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem248Q3TBN1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem248Q3TBN1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem248Q3TBN1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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