Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Zbtb38Q3LR78 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Zbtb38Q3LR78 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Zbtb38Q3LR78 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb38Q3LR78 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms