Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Col24a1Q30D77 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Col24a1Q30D77 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Col24a1Q30D77 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col24a1Q30D77 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms