Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms