Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms