Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms