Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnma1Q08460 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms