Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms