Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox8Q04886 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms