Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna1sQ02789 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms