Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb4Q02738 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms