Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms