Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EgfrQ01279 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms