Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms