Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms