Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

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Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms