Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms