Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcc1P97496 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms