Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ptprn2P80560 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ptprn2P80560 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ptprn2P80560 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ptprn2P80560 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms