Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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