Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms