Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp7P70280 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp7P70280 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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