Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ufm1P61961 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms