Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lim2P56563 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lim2P56563 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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