Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms